相信大家都用过本地版的 Rstudio,也时常被电脑卡死所困扰,也有用自己笔记本处理单细胞数据内存不够的 error,怎么解决?

Rstudio 官方其实有个可以在本地服务器安装的 server 版,也就是使用服务器的硬件配置,用自己的工作电脑登录浏览器就可以使用,避免以上问题。

那么接下来,和我一起配置起来:

一、环境

系统:Debian 10 / Ubuntu 18 / Ubuntu 20

R版本:> 3.0

二、安装

sudo apt-get install r-base
sudo apt-get install gdebi-core
wget https://download2.rstudio.org/server/bionic/amd64/rstudio-server-2021.09.0-351-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-server-2021.09.0-351-amd64.deb

安装完成后如图所示:img

现在回到你的浏览器中输入:your_id:8787

即可看到登录页面,这里输入用户名和密码即可登录

img

登录后,与本地版 Rstudio 界面与用法相同

img

如果登录不了,可能原因是防火墙拦截端口

需要安装

sudo apt-get update 
sudo apt-get install iptables
sudo apt-get install iptables-persistent

运行命令

# 开放端口
iptables -I INPUT -p tcp --dport 8787 -j ACCEPT
iptables -I OUTPUT -p udp --dport 8787 -j ACCEPT
# 开放端口
iptables -I INPUT -p tcp --dport 8787 -j ACCEPT
iptables -I OUTPUT -p udp --dport 8787 -j ACCEPT
# 保存防火墙规则, /etc/iptables/rules.v4
sudo netfilter-persistent save

三、常用操作

重启

sudo rstudio-server restart

关闭

sudo rstudio-server stop

启动

sudo rstudio-server start

检测配置文件

配置文件后,用于文件自检

sudo rstudio-server verify-installation

查看状态

按 q 退出

sudo rstudio-server status

正在运行状态

img

停止运行或运行错误状态

img

四、配置

安装完成后,会有两个 Rstudio-server 配置文件,如果不存在手动创建即可

!!!如果不清楚配置选项意义,请勿更改,可以会引起 Rstudio server 运行异常

/etc/rstudio/rserver.conf
/etc/rstudio/rsession.conf

rserver.conf 配置清单

# 监听端口,默认为 8787
www-port=8787
# 地址,默认为0.0.0.0,会接收任何IP连接
www-address=0.0.0.0
# 指定库文件路径,一般不需要改动,可以用于添加系统标准库,第三方外部库文件依赖
rsession-ld-library-path=/opt/local/lib:/opt/local/someapp/lib
# 指定 R 路径
rsession-which-r=/usr/local/bin/R
# 监听端口,默认为 8787
www-port=8787
# 地址,默认为0.0.0.0,会接收任何IP连接
www-address=0.0.0.0
# 指定库文件路径,一般不需要改动,可以用于添加系统标准库,第三方外部库文件依赖
rsession-ld-library-path=/opt/local/lib:/opt/local/someapp/lib
# 指定 R 路径
rsession-which-r=/usr/local/bin/R
# 设置用户权限
auth-required-user-group=rstudio_users

rsession.conf 配置清单

# 会话超时,默认 2 小时 Rstudio 没有操作就会断开服务器连接,如果有任务运行这不会断开
session-timeout-minutes=120
# 设置R包路径,默认在~/R/packages
r-libs-user=~/R/packages
# 会话超时,默认 2 小时 Rstudio 没有操作就会断开服务器连接,如果有任务运行这不会断开
session-timeout-minutes=120
# 设置R包路径,默认在~/R/packages
r-libs-user=~/R/packages
# 镜像设置
r-cran-repos=https://mirrors.nics.utk.edu/cran/

参考

https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552316-Configuring-the-Server